Năm 2013, lệ phí cho thí sinh thuộc diện xét tuyển hoặc tuyển thẳng vào các ĐH-CĐ: 30.000 đồng/hồ sơ, tăng gấp đôi so với mức 15.000 đồng/hồ sơ năm 2012.

Lệ phí đăng ký dự thi các ĐH-CĐ là 60.000 đồng, nhiều hơn 10.000 đồng so với mức 50.00 đồng của năm 2012.

Lệ phí sơ tuyển (đối với trường có tổ chức sơ tuyển trước khi thi chính thức) được chia ra 2 mức: Sơ tuyển đối với các ngành năng khiếu: 120.000 đồng/hồ sơ (bao gồm tất cả các môn), tăng 20.000 đồng so với mức 100.000 đồng của năm 2012. Lệ phí sơ tuyển đối với các ngành khác: 50.000 đồng/hồ sơ (bao gồm tất cả các môn), tăng 10.000 đồng so với năm 2012.

Mức lệ phí dự tuyển vào các ĐH-CĐ-TCCN cũng được điều chỉnh tăng hơn năm 2012.

Lệ phí dự thi văn hoá: 45.000 đồng/hồ sơ (bao gồm tất cả các môn), tăng 15.000 đồng. Dự thi năng khiếu: 300.000 đồng/hồ sơ (bao gồm tất cả các môn), tăng 100.000 đồng.

Lệ phí tuyển sinh sau đại học cũng tăng. Phí đăng ký dự thi: 60.000 đồng/hồ sơ, tăng 10.000 đồng; dự thi cao học: 120.000 đồng/hồ sơ, tăng 20.000 đồng;

Phí dự tuyển nghiên cứu sinh và đăng ký xét tuyển đào tạo ở nước ngoài bằng ngân sách nhà nước được giữ nguyên ở mức 200.000 thí sinh/hồ sơ.