Vào thời gian trên, đoàn tàu SE5 đang chạy hướng Hà Nội - TP HCM, khi đến địa điểm trên thì bất ngờ gặp một thanh niên băng qua đường sắt. Do quá gần, không kịp xử lý nên tàu đã tông trực diện khiến nạn nhân tử vong ngay tại chỗ.

Nạn nhân xấu số chưa xác định được danh tính, là công nhân làm việc tại công trường sửa chữa mặt cầu Phủ Lý, thuộc Quốc lộ 1A, nằm cạnh cầu đường sắt Bắc Nam.

Theo một số người chứng kiến vụ tai nạn, khi anh này băng qua đường sắt, mọi người đã hò hét cảnh báo, lái tàu cũng đã kéo còi nhưng người công nhân đã không kịp phản ứng.

Do vị trí tai nạn xảy ra nằm song song với Quốc lộ 1A, lại đang thi công sửa chữa cầu nên đã gây ùn tắc giao thông cục bộ.