Theo Đề án, giai đoạn từ 2012 đến 2015, xây dựng hoàn chỉnh hệ thống trụ sở làm việc cho toàn ngành, bao gồm: Trụ sở cơ quan Kiểm toán Nhà nước Trung ương và 10 trụ sở Kiểm toán Nhà nước Khu vực IV, V, VI, VII, VIII, IX, X, XI, XII, XIII.

Về kinh phí thực hiện Đề án, tổng kinh phí đầu tư xây dựng hệ thống trụ sở làm việc là 2.396,84 tỷ đồng, trong đó vốn ngân sách nhà nước chiếm 98,6% tổng kinh phí đầu tư của đề án (2.362,84 tỷ đồng)...

Theo quyết định trên, trụ sở cơ quan Kiểm toán Nhà nước Trung ương sẽ được hoàn thành đưa vào sử dụng năm 2015 với vốn đầu tư 975 tỷ đồng. Trụ sở Kiểm toán Nhà nước khu vực IV, V, VI,VII,VIII, IX, thời gian thực hiện năm 2011 - 2015 vốn đầu tư là 701,84 tỷ đồng.

Trụ sở Kiểm toán Nhà nước khu vực X, XI, XII,XII thời gian thực hiện từ 2013-2015 với vốn đầu tư là 480 tỷ đồng và Trụ sở Kiểm toán Nhà nước khu vực XIV, XV thời gian thực hiện từ 2016-2018, vốn đầu tư là 240 tỷ đồng.