Chánh thanh tra Bộ GD-ĐT Nguyễn Huy Bằng cho biết, trong thời gian nói trên đoàn thanh tra sẽ làm rõ 4 nội dung lớn có dấu hiệu vi phạm mà báo Nhân dân đã phản ánh.
Thứ nhất là về vấn đề tài chính, gồm có việc thu tiền công tác phí của các giảng viên đi học nước ngoài, việc nộp lại tiền của cán bộ, giảng viên tham gia dự án do EU tài trợ và chi phí 221 triệu đồng cho Ban quản lí dự án, việc quản lý tiền luyện thi sau ĐH thu được từ năm 2009 đến nay.
Thứ hai, về cơ sở vật chất: Làm rõ việc sửa chữa cải tạo nhà A; Việc chậm khắc phục và sửa chữa công trình tại nhà B, D; Việc xây dựng và sửa chữa phòng học chương trình tiên tiến; Việc trang thiết bị tại một số phòng ban, việc tăng kinh phí xây dựng tòa nhà 12 tầng.
Thứ ba, về công tác tuyển sinh: Việc chuyển đổi môn thi đầu vào của chuyên ngành Quản trị kinh doanh (từ môn Kinh tế học sang môn Quản trị học) trong kỳ thi cao học năm 2012; Việc mở các lớp đào tạo, bồi dưỡng kiến thức ngắn hạn giữa khoa Sau ĐH và khoa Quốc tế.
Cuối cùng thanh tra về công tác tổ chức, cụ thể là việc đi nước ngoài của Hiệu trưởng trong khoảng thời gian từ tháng 2/2010 đến tháng 10/2012; Những phản ánh liên quan đến cuộc họp của Hội đồng chức danh GS cơ sở của trường năm 2012 liên quan đến Phó hiệu trưởng Đào Thị Thu Giang.
Được biết, Hiệu trường nhà trường GS Hoàng Văn Châu đã có báo cáo giải trình đoàn tranh tra về những vấn đề nên trên.