Quá trình điều tra, Công an tỉnh Quảng Trị xác định, Phương chính là đồng phạm trong vụ án lừa đảo chiếm đoạt tài sản, làm giả hài cốt liệt sĩ tại xã Gio Mai, huyện Gio Linh, tỉnh Quảng Trị, với hai kẻ cầm đầu là chị gái và anh rể Nguyễn Thanh Thúy.
Trước đó, ngày 23/10/2013, Cơ quan An ninh điều tra Công an tỉnh Quảng Trị đã tiến hành bắt tạm giam đối tượng Nguyễn Thanh Thúy và vợ là Mẫn Thị Duyên, với cùng tội danh lừa đảo chiếm đoạt tài sản trong vụ cất bốc hài cốt liệt sĩ tại xã Gio Mai, huyện Gio Linh. Kết quả giám định các mẫu xương tại các hố chôn do “cậu” Thủy cất bốc tại xã Gio Mai cho thấy hầu hết là xương động vật và những di vật được làm giả. Liên quan đến vụ án, vào tháng 2-2014, Công an tỉnh Quảng Trị đã gia hạn tạm giam thêm 4 tháng đối với vợ chồng “cậu” Thủy để phục vụ công tác điều tra.
Hiện cơ quan công an đang di lý Phương vào Quảng Trị để phục vụ công tác điều tra mở rộng vụ án.